宇智波佐助的右臂是在和漩涡鸣人的终结谷最终决战中丢失的。这场战斗是两人理念冲突的巅峰对决，佐助试图通过武力改变忍界秩序，而鸣人则坚持用领会和羁绊化解仇恨。战斗中，双方各自施展绝顶忍术——鸣人的螺旋丸和佐助的千鸟正面碰撞，巨大的能量冲击导致两人同时失去一条手臂。佐助的右臂因查克拉耗尽无法再生，而鸣人则通过柱间细胞移植恢复了手臂。这一情节在游戏中通常以剧情动画或独特战斗场景还原，玩家需注意在相关关卡中规避高伤害技能以避免人物陷入残血情形。

游戏内若想尝试佐助断臂的剧情，需完成主线任务终末之谷之战。该关卡分为多个阶段，第一阶段需操控佐助和鸣人进行忍术对拼，体系会强制触发QTE（快速反应事件），成功输入指令后可进入第二阶段。此阶段佐助会开始完全体须佐能乎，而鸣人则进入六道玩法，玩家需合理利用须佐的防御和攻击节拍，避免被鸣人的连续体术压制。当战斗进入最终阶段时，体系会播放断臂动画，随后进入残血情形下的极点操作环节。

在后续剧情或自在玩法中，玩家操控的佐助将无法运用部分十根手指头结印的忍术，但须佐能乎和雷遁系技能的威力会得到强化补偿。加具土命和炎遁·豪火球可通过一只手结印释放，且消耗查克拉量减少20%。断臂情形下的佐助在PVP玩法中拥有特殊的闪避动作，可利用须佐骨架短暂格挡超距离攻击，但需注意防御次数限制。

若玩家希望恢复佐助的手臂，需在博人传DLC中完成隐藏任务赎罪之路。该任务标准佐助和鸣人好感度达到满级，并收集散落的白绝细胞道具。任务完成后可解开独特剧情，佐助将佩戴义肢回归，但义肢仅提供外观变化，不影响战斗数值。部分高难度副本会强制禁用义肢，以还原原作中佐助的残障战斗风格。

佐助断臂是游戏剧情和机制设计的重要节点。玩家需适应其战斗风格的变化，并合理利用须佐能乎的霸体特性弥补近战缺陷。在PVE玩法中，可组合鹰小队成员香燐的恢复技能提高续航能力；PVP玩法则提议优先强化雷遁突进技能，以弥补一只手结印的灵活性不足。